کمک در تشخیص ویروسی شدن سرور Cent os

با سلام میخواستم بدونم چطور میشه بدون آنتی ویروس تشخیص داد که سرور cent os 7  ویروسی شده؟

داستان اینه که من تو بخش آی تی یه اداره دولتی هستم و این سرور برنامه ی روش هست که به دلایل نامشخصی سه چهار روز یه بار قطع میشه و از شرکت خصوصی باید هر بار وصل شن و مشکلشو حل کنن تا درست شه. پس از چند بار درخواست از شرکت خصوصی برای رفع دائمی این مشکل حالا اونا مدعی شدن که این سرور ویروسی شده و علت قطع شدن برنامه ما هم همینه و حالا گفتن که برنامه مجدد باید نصب شه و فاکتور جدید برامون فرستادن. حالا میخوام اساتید گرامی کمک کنن که اولا چطور میشه روی سیستمی که آنتی ویروس نداره تشخیص داد که ویروسی شده و دوما علت قطع اون برنامه هم همین ویروسه. ممنون میشم کمک کنید. و چه مستنداتی ازشون در این مورد بخوام، دانش لینوکسی منم بسیار کمه

خودم حدس میزنم ممکنه از تنظیمات اوراکل نصب شده روی cent os  باشه آخه وقتی دستور top  رو میزنم cpu حدود 600 درصد درگیره!!